營利事業申報房地交易所得時，如果資產符合房地合一課稅新制，另有其計算公式。財政部台北國稅局提醒，土地漲價的價值已經在土地增值稅中進行計算，企業不應該再將土增稅列為房地交易成本，否則會變成重覆減除。

台北國稅局表示，該局轄內有一甲公司，申報106年度營利事業所得稅結算時，列報適用房地合一新制之房地交易所得120萬元，這筆所得額應該要以出售房地收入為基準，再減除取得成本、必要費用以及土地漲價總數額。但是國稅局人員稽查後發現，甲公司申報的「必要費用」當中，竟包含了不得列為成本費用的「土地增值稅」，剔除該筆多列計的費用後，額外調增課稅所得額50萬元，依據當年度營所稅率補徵稅額8.5萬元。